يمكن أن ينتج ألم المستقيم عن إصابة أو التهاب أو عدوى تصيب المستقيم أو فتحة الشرج، وتعد البواسير والتهاب البروستاتا وبطانة الرحم من بين العديد من الأسباب المحتملة، ويعتمد العلاج على السبب.
تعد البواسير هي مشكلة شائعة، يمكن لهذه الأوردة المنتفخة داخل المستقيم أو خارج فتحة الشرج أن تسبب الألم والحكة الشرجية ونزيف المستقيم
تكون البواسير أوردة منتفخة، تشبه الدوالي في الجزء السفلي من المستقيم والشرج وفي بعض الأحيان، تمتد جدران هذه الأوعية الدموية بشكل رقيق للغاية مما يؤدي إلى انتفاخ الأوردة وتهيجها، خاصة عند التبرز.