تكثر التحذيرات من تناول الطعام بعد فترة طويلة من طهية دون حفظه جيدا و التأكد من أنه مازال صالحا للتناول، لأنه قد يتسبب في مضاعفات خطيره بسبب كونه أرض خصبة لنمو البكتيريا.
المشكلة في أفران الميكروويف لا تكمن فقط في الإشعاعات التي من الممكن أن تتعرض لها مباشرة، بل إنها تكمن أساسا في كون أن تلك الإشعاعات الصادرة ما هي إلا عبارة عن موجات لاسلكية فائقة التردد
الميكرويف يُنشِئ مادّة الأكريلاميد ، وهي عبارة عن مادة كيميائيّة تسبب مرض السرطان، كما أشارت العديد من الدراسات إلى أن إنتاج مادة الأكريلاميد يكون أكثر في حال استخدام أفران ميكرويف ذات طاقة عالية