يمكن أن ينتج ألم المستقيم عن إصابة أو التهاب أو عدوى تصيب المستقيم أو فتحة الشرج، وتعد البواسير والتهاب البروستاتا وبطانة الرحم من بين العديد من الأسباب المحتملة، ويعتمد العلاج على السبب.